战舰操作是无尽的拉格朗日的核心玩法之一，合理运用计划圈与策略值是基础。所有舰队行动必须在计划圈内执行，包括采矿、移动或战斗指令。策略值每小时回复20点，调动消耗5点，攻击消耗10点，跨计划圈行动固定消耗20点，需优先规划高价值目标。曲率移动能实现5倍速跨星系航行，但需目标区域存在己方建筑或舰队。资源采集需派遣工程船至计划圈内矿点，不同规模的工程船效率差异显著，建议优先部署大型工程船。
舰船强化依赖技术值系统，每提升一级蓝图可获得1点技术值。武器系统强化优先提升主火力模块伤害，装甲系统增强护盾与耐久，动力系统优化移动速度或闪避率。巡洋舰等大型舰船需注意速度差异，低速型号可能延误战机，建议搭配高速驱逐舰协同作战。对抗航母时需配备防空型舰船如光锥级，遭遇战列舰则适用鱼雷舰针对性打击。技术值分配需结合舰种定位，前排防御舰优先护甲，中后排输出舰侧重冷却与暴击属性。
舰队编组需兼顾人口限制与功能互补，战斗舰与工程舰人口独立计算。常规配置以前排防御舰（如奇美拉巡洋舰）承担伤害，中后排配置卡利斯托等输出舰，剩余人口补充防空或特殊功能舰船。载机航母需搭配强效战机，维修艇需重点保护以防消耗战。包夹战术可绕过前排直接打击中后排，分兵操作时需确保各编队速度协调，避免低速战巡拖累整体机动性。
前哨站是战略调度的关键节点，可实现基地迁移与自动采矿。建造前需评估资源分布，对接矿点后能持续收获资源。遭遇敌方攻击时应通过同盟频道求援，必要时采用增援指令快速补充舰队。探索阶段建议携带侦察型舰船，其满级动力系统能显著扩大侦查范围。战斗回顾功能可分析敌方伤害类型，据此调整护甲属性或闪避加点方案。
战术执行需注重战场动态，手动控制集火顺序优先消灭维修艇与高威胁单位。攻城作战需配备诺玛M470等专用舰船，拆除建筑效率远超常规舰队。撤退指令可保留残存舰队，但会返回原始位置。赛季重置机制要求玩家重新规划发展路线，前期应侧重资源积累而非盲目扩张。最终舰队的强度取决于蓝图研究深度与战术适配性，需长期优化子系统搭配与技能组合。
